طبق اعلام موسسه استنادی و پایش علم و فناوری جهان اسلام(ISC)، دانشگاه علوم پزشکی شیراز جزو سه دانشگاه علوم پزشکی و مجموع ۱۰ دانشگاه حضور یافته از جمهوری اسلامی ایران در این نظام رتبه بندی است.

بر اساس تازه ترین رتبه بندی شانگهای که در سال ۲۰۲۳ منتشر شده است، دانشگاه علوم پزشکی شیراز جزو هزار دانشگاه برتر جهان و همچنین رتبه سوم در سطح وزارت بهداشت، پس از دانشگاه های علوم پزشکی تهران و شهید بهشتی است.

رتبه بندی شانگهای با پیشینه ۲۱ ساله، یکی از رتبه بندی های مشهور و معتبر جهانی در کنار رتبه بندی هایی مانند کیو اس و تایمز است، که از سوی دانشگاه شانگهای ژیائوتنگ به صورت سالیانه به روز رسانی و منتشر می شود.

تعداد دانش آموختگان برنده جایزه نوبل یا نشان فیلدز، تعداد اعضای هیئت علمی برنده جایزه نوبل یا نشان فیلدز، تعداد پژوهشگران پراستناد، تعداد مقالات منتشر شده در نشریات نیچر و ساینس، تعداد مقالات نمایه شده در نمایه‌نامه‌های توسعه یافته علوم و علوم اجتماعی و همچنین عملکرد دانشگاهی با توجه به اندازه سازمان، شش شاخص ارزیابی در نظام رتبه بندی شانگهای هستند.